高中生偵探工藤新一，以高超的推理能力破獲了不少令警察們束手無策的懸案，成為了名噪一時的名偵探。
然而命運之神卻跟他開了個大玩笑，在一次和他女朋友小蘭約會的時候，新一無意間目睹了兩個黑衣人進行非法交易。因看的太入神，被另一名黑衣人從背後擊昏。而黑衣人趁機給新一喂下了犯罪組織新研究的毒藥。
結果新一雖然幸運沒死，可是當他醒過來的時候居然不可思議的【變成了五歲的小女孩】！
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